De collectie weerspiegelt de brede protestantse traditie in Nederland. Hervormd, gereformeerd of evangelisch, traditioneel of progressief-christelijk. Van vele personen en instellingen op het gebied van religie, politiek, onderwijs en maatschappelijke actie zijn de archieven hier te vinden. De Collectie HDC | Protestants erfgoed is verbonden met het HDC Centre for Religious History.
De collectie HDC | Protestants Erfgoed beheert zo'n drie kilometer particuliere, protestantse archieven. Deze collecties kunnen voor studie, onderwijs en onderzoek geraadpleegd worden op de studiezaal Bijzondere Collecties van de UB.
In de fotocollectie staat een grote collectie foto’s afkomstig uit de archieven. Momenteel kan niet van alle foto’s worden vastgesteld wie de maker en/of de rechthebbende is. Daarom worden de foto’s (voorlopig) niet getoond. De metadata blijft beschikbaar en doorzoekbaar.
Er zijn diverse databases beschikbaar, zoals het BNPP en het IGKN. Daarnaast beheert de collectie HDC | Protestants Erfgoed ook een aantal gedigitaliseerde archieven.
De tijdschriften verzameling die de collectie HDC | Protestants Erfgoed beheerde, is toegevoegd aan de bibliotheekcollectie. Een deel van deze tijdschriften is nog niet beschreven in de catalogus, maar deze collectie is toch doorzoekbaar.