De Vrije Universiteit Amsterdam beheert diverse archieven, zowel uit de eigen organisatie als erbuiten. Zo kun je bij de Universiteitsbibliotheek terecht voor de rijke archieven van de collectie HDC | Protestants Erfgoed en de VU-archieven die deel uitmaken van het academisch erfgoed. Daarnaast is een deel ondergebracht bij het Stadsarchief Amsterdam.
In de periode 2020-2025 werd het gehele archief van de VU bewerkt en geïnventariseerd. Een deel daarvan ging naar het Stadsarchief Amsterdam, een deel is onder beheer van de UB.
