Sinds de jaren 50 beschikt de VU over een steeds verder uitgebreide collectie fossielen, gesteenten, mineralen en bijbehorende modellen.
Aardwetenschappers verzamelen veel, en studenten leren door voorbeelden te bekijken en vergelijken. De collecties worden heden ten dage steeds minder gebruikt, en kleine selecties zijn al opgenomen in de erfgoedcollectie. Zoals de synthetische kristallen uit de jaren 30, gebruikt in het mineralogie-onderwijs, en modellen van mineralen.