De collectie Bijbels Museum bestaat uit verschillende deelcollecties die afkomstig zijn uit het Bijbels Museum te Amsterdam. De collecties zijn in 2020 geschonken aan de VU. Een deel van de boeken uit de collectie wordt momenteel nog ingewerkt.
Er zijn drie deelcollecties te onderscheiden, te weten:
- Bijbels: ongeveer 2500 Bijbels uit de 16e tot 20e eeuw.
- Bijbelse opvoeding: kinderbijbels en stichtelijke literatuur, voornamelijk laat 19e-eeuws en 20e-eeuws materiaal. Het gaat om circa 1500 werken.
- Kaarten en prenten: enkele tientallen kaarten, atlassen en reisbeschrijvingen van het Heilige Land. Daarnaast prenten en prentseries met Bijbelse voorstellingen.
Het archief van het Bijbels Museum en haar rechtsvoorgangers wordt bewaard bij het Historisch Documentatiecentrum voor het Nederlands Protestantisme onder nummer 1162.