Dit baanbrekende onderzoek naar de automatisering van glycomische processen en de ontdekking van glycaanbiomarkers, onder supervisie van de professoren M. Wuhrer (LUMC) en G.W. Somsen (VU) en Dr. D. Fernandes (Ludger Ltd), slaat een brug tussen glycomics en translationele geneeskunde en biedt baanbrekende methoden die de klinische diagnostiek en de ontwikkeling van geneesmiddelen kunnen transformeren.
Een brug slaan tussen glycomica en biofarmaceutica
Het onderzoek van Dr. Shubhakar richt zich op twee kritieke doelen: het verbeteren van glycaananalyse voor biofarmaceutica en het ontdekken van glycaanbiomarkers, specifiek voor inflammatoire darmziekten (IBD). Door het ontwikkelen van geautomatiseerde, high-throughput (HT) workflows, stroomlijnde ze traditionele glycaanpreparatieprocessen, waardoor de uitgebreide hands-on tijd die voorheen nodig was werd verminderd. Deze methoden werden gevalideerd met behulp van geavanceerde analytische platforms zoals MALDI-TOF-MS en LC-MS, waarbij nauwkeurigheid en reproduceerbaarheid werden aangetoond die vergelijkbaar zijn met traditionele glycomische benaderingen.
Innovaties in glycomische technologie
Hoofdstuk 3 van haar proefschrift introduceerde een nieuw geautomatiseerd permethyleringsproces voor glycaanbereiding, dat in staat is om grote monstervolumes efficiënt te verwerken. Door complexe monsters van muisweefsel te analyseren, toonden Shubhakar et al. aan dat de geautomatiseerde workflow niet alleen de nauwkeurigheid handhaafde, maar ook een snellere, schaalbare analyse bood, waardoor het van onschatbare waarde werd voor biofarmaceutische toepassingen. Deze technologie zou productieprocessen bij de ontwikkeling van medicijnen kunnen verbeteren door glycosyleringsgegevens van hoge kwaliteit te leveren.
Een toekomst voor gepersonaliseerde geneeskunde
Hoofdstuk 5 van het onderzoek van Dr. Shubhakar paste glycaanbiomarkerbevindingen toe op IBD en presenteerde een voorspellend model voor de escalatie van behandelingen op basis van glycaanprofilering. De bevindingen suggereren een veelbelovende toekomst voor gepersonaliseerde geneeskunde, waarbij glycaanbiomarkers kunnen helpen om behandelingen af te stemmen op de individuele behoeften van patiënten, waardoor zowel de fysieke als de financiële lasten van chronische ziekten zoals IBD worden verminderd.
Toekomstperspectieven
Dr. Shubhakar keek terug op haar prestaties en toonde zich enthousiast over het potentieel van haar werk op het gebied van biofarmaceutische innovatie en gepersonaliseerde geneeskunde. Haar bijdragen leggen een waardevolle basis voor toekomstig glycomisch onderzoek, waardoor de weg wordt vrijgemaakt voor preciezere en toegankelijkere glycaangebaseerde diagnostica en therapeutica.
Haar verdediging markeert een mijlpaal voor zowel de Vrije Universiteit Amsterdam als Ludger Ltd, waar de industrieel-academische samenwerking een voorbeeld is van de transformerende impact van interdisciplinaire partnerschappen in het bevorderen van de gezondheidswetenschap en klinische diagnostiek.
Haar proefschrift is nu beschikbaar voor het publiek en draagt bij aan de voortdurende verkenning van glycanen in gezondheid en ziekte. Download de PDF van het proefschrift uit de VU repository.